2016年，云阳县有卫生机构783个，其中医院10个，卫生院43个，妇幼保健院、专科医疗防治所、疾病预防控制中心、卫生监督机构各1个，社区卫生服务中心（站）2个，诊所、卫生所112个，村卫生室612个。卫生机构床位数4939张。卫生机构人员（在岗职工）6123人。其中卫生技术人员5360人。卫生技术人员中，执业医师和执业助理医师共1657人，注册护师（护士）1346人。建成标准化村卫生室93个，村卫生室标准化率达100%，基本公共卫生服务实现全覆盖。县新中医院投入使用，县医院迁扩建项目完成住院楼、门诊医技楼等主体工程。开展孕妇产前免费检查1.51万名。其中唐氏筛查3281人，孕期B超9643人，孕前优生检查2128对。完成农村适龄妇女“两癌”免费检查3.36万名。计生奖扶特扶、两孩政策全面落实，被评为全国计划生育优质服务县。